苏晓泉，博士，教授，博士生导师，民盟盟员。泰山学者青年专家，山东省青创人才引育团队带头人，山东省优秀研究生导师。青岛大学特聘教授，计算机科学技术学院副院长。研究方向为生物信息学、微生物组学、大数据科学等，已在该领域内mBio、mSystems、Bioinformatics、Advanced Intelligent Systems等高水平期刊发表学术论文70余篇，主持国家自然科学基金项目3项、国家重点研发计划任务、山东省自然基金重大基础项目、中科院重点部署项目子课题等，相关成果获得10余项软件著作权。担任mSystems、BMC Bioinformatics等期刊编委，CCF高级会员，中国生物物理学会肠道菌群分会委员，中国生物工程学会人工智能与生物技术专委会委员，ISCB-China理事，山东省生物信息学会常务理事，山东省人工智能学会理事。民盟山东海洋委员会常务副主任，民盟青岛大学基层委员会副主委。
课题组网站
https://www.x-mol.com/groups/bioinfo_qdu
研究方向
生物信息学，算法设计，高性能计算，数据挖掘
教育背景
2015-2019 中国科学院大学 微生物学（生物信息方向） 博士
2010-2011 纽约州立大学石溪分校 (SUNY Stony Brook) 计算机科学 硕士
2005-2009 武汉大学 计算机科学与技术 学士
工作经历
2020-今 青岛大学 计算机科学技术学院，教授，博导，特聘教授
2017-2020 中国科学院 青岛生物能源与过程研究所 副研究员，硕导
2016 加州大学圣迭戈分校 (UC San Diego) 国家公派访问学者
2014 香港城市大学（City University of Hong Kong） 高级研究助理
2011-2016 中国科学院 青岛生物能源与过程研究所 助理研究员
科研项目
1. 国家重点研发计划，2021，任务负责人
2. “科创甬江2035”重点研发计划项目，2025，任务负责人
3. 青岛市自然科学基金 重点项目，2025，任务负责人
4. 山东省青创人才引育计划，2021，团队带头人
5. 山东省泰山学者计划，2022，项目负责人
6. 国家自然科学基金 面上项目，2021，项目负责人
7. 国家自然科学基金 国家重大科研仪器研制项目，2019，任务负责人
8. 国家自然科学基金 面上项目，2018, 项目负责人
9. 山东省自然科学基金 重大基础研究项目, 2017，项目负责人
近期论文
1. Zhang, et al., Phylo-Spec: a phylogeny-fusion deep learning model advances microbiome status identification. mSystems, 2025. (通讯)
2. Wang, Gao, et al., Coordinated Meta-Storms enables comparison of million-level microbiomes. Bioinformatics, 2025. (通讯)
3. Zhang, et al., CAM-net: a context-aware network for identifying reliable microbial relations via propagation cliques. Briefing in Bioinformatics, 2025. (通讯)
4. Wang, et al., Microbial dysbiosis and its diagnostic potential in androgenetic alopecia: insights from multi-kingdom sequencing and machine learning. mSystems, 2025. (通讯)
5. Zhang, Wang, et al., Function Inference of Million-Scale Microbiomes Using Multi-GPU Acceleration. Microbiology Spectrum, 2025. (通讯)
6. Hou, et al., MEFE: microbiome signature identification based on elastic feature extraction. Frontiers of Computer Sciences (Higher Education Press), 2025. (通讯)
7. Gao, et al., Concisemizer: An Asymmetric Redundancy-Removal Algorithm for Efficient Seed Sampling in Large-Scale Sequence Alignment. IEEE BIBM, 2025. (通讯)
8. Shi, et al., PM-profiler: a high-resolution and fast tool for taxonomy annotation of amplicon-based microbiome. Microbiology Spectrum, 2024. (通讯)
9. Zhang, et al., Flex Meta-Storms elucidates the microbiome local beta-diversity under specific phenotypes. Bioinformatics, 2023. (通讯)
10. Wu, Li, et al., Host variable embedding augments microbiome-based simultaneous detection of multiple disease by deep learning. Advanced Intelligent Systems, 2023. (通讯)
11. Chen, Li, et al., Parallel-Meta Suite: interactive and rapid microbiome data analysis on multiple platforms. iMeta, 2022. (通讯)
12. Sun, Liu, et al, Comprehensive understanding to the public health risk of environmental microbes via a microbiome-based index. J. Genet. Genomics, 2022. (通讯)
13. Jing, Zhang, et al., A Scale-Free, Fully Connected Global Transition Network Underlies Known Microbiome Diversity. mSystems, 2021. (通讯)
14. Su*, et al., Elucidating the Beta-Diversity of the Microbiome: from Global Alignment to Local Alignment. mSystems, 2021. (一作&通讯)
15. Jing, Liu, et al. Microbiome Search Engine 2: a Platform for Taxonomic and Functional Search of Global Microbiomes on the Whole-Microbiome Level. mSystems, 2021. (通讯)
知识产权
1. 软件著作权：基于微生物组全流程疾病检测系统，登记号：2025SR1849422
2. 软件著作权：基于微生物组跨队列疾病诊断系统，登记号：2025SR1685769
3. 软件著作权：Microbiome GPU-based Function inference，登记号：2025SR1640717
4. 软件著作权：基于多GPU的微生物组相似性计算系统，登记号：2025SR1349801
5. 软件著作权：Phylo-Spec微生物组状态检测系统，登记号：2025SR1470190
6. 软件著作权：微生物组演化追踪系统，登记号：2025SR0962590
7. 软件著作权：PM-profiler微生物组分析软件，登记号：2024SR0893929
8. 软件著作权：Flex Meta-Storms，登记号：2023SR0207831
9. 软件著作权：Parallel-Meta Suite，登记号：2022SR0929246
10. 软件著作权：微生物组功能分层比对系统，登记号：2021SR0952303
联系方式
Email: suxq-AT-qdu-DOT-edu-DOT-cn
