苏晓泉，博士，教授，博士生导师。泰山学者青年专家，山东省青创人才引育团队带头人，CCF高级会员，青岛大学特聘教授，计算机科学技术学院副院长。研究方向为生物信息学、微生物组学、大数据科学等，已在该领域内mBio、mSystems、Bioinformatics、Advanced Intelligent Systems等高水平期刊发表学术论文60余篇，主持国家自然科学基金项目3项、国家重点研发计划任务、山东省自然基金重大基础项目、中科院重点部署项目子课题等，相关成果获得10余项软件著作权。担任iMeta、BMC Bioinformatics、Medicine in Microecology等期刊编委，山东省生物信息学会理事，山东省人工智能学会理事。
研究方向
生物信息学，算法设计，高性能计算，数据挖掘
教育背景
2015-2019中国科学院大学微生物学（生物信息方向）博士
2010-2011纽约州立大学石溪分校(SUNY Stony Brook)计算机科学硕士
2005-2009武汉大学计算机科学与技术学士
工作经历
2020-今青岛大学计算机科学技术学院，教授，博导，特聘教授
2017-2020中国科学院青岛生物能源与过程研究所副研究员，硕导
2016加州大学圣迭戈分校(UC San Diego)国家公派访问学者
2014香港城市大学（City University of Hong Kong）高级研究助理
2011-2016中国科学院青岛生物能源与过程研究所助理研究员
科研项目
1.国家重点研发计划科学数据自主应用软件研发，2022-2025，任务负责人
2.山东省青创人才引育计划，2021-2024，团队带头人
3.山东省泰山学者计划，2022-2025，项目负责人
4.国家自然科学基金面上项目，2021-2024，项目负责人
5.国家自然科学基金国家重大科研仪器研制项目，2019-2023，任务负责人
6.国家自然科学基金面上项目，2018-2022,项目负责人
7.山东省自然科学基金重大基础研究项目, 2017-2019，项目负责人
8.中国科学院重点部署项目，2017-2019，子课题负责人
近期论文
1. Shi, et al., PM-profiler: a high-resolution and fast tool for taxonomy annotation of amplicon-based microbiome.Microbiology Spectrum, 2024. (通讯)
2. Jia, et al., A deep learning framework for predicting disease-gene associations with functional modules and graph augmentation.BMC Bioinformatics, 2024. (通讯)
3. Zhou, et al., ACMGA: a reference-free multiple-genome alignment pipeline for plant species.BMC Genomics, 2024. (通讯)
4. Wang, et al., PM-CNN: microbiome status recognition and disease detection model based on phylogeny and multi-path neural network.Bioinformatics Advances, 2024. (通讯)
5. Zhang, et al., Flex Meta-Storms elucidates the microbiome local beta-diversity under specific phenotypes.Bioinformatics, 2023. (通讯)
6. Wu, Li, et al., Host variable embedding augments microbiome-based simultaneous detection of multiple disease by deep learning.Advanced Intelligent Systems, 2023. (通讯)
7. Zhang, et al., Comprehensive Assessment of 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing for Microbiome Profiling across Multiple Habitats.Microbiology Spectrum, 2023. (通讯)
8. Jiang, Zhang, et al., Gut microbiome predicts selenium supplementation efficiency across different Chinese adult cohorts using hybrid modeling and feature refining.Frontiers in Microbiology, 2023. (通讯)
9. Xing, et al., Discovering Microbe-disease Associations with Weighted Graph Convolution Networks and Taxonomy Common Tree.Current Bioinformatics, 2023. (通讯)
10. Chen, Li, et al., Parallel-Meta Suite: interactive and rapid microbiome data analysis on multiple platforms.iMeta, 2022. (通讯)
11. Sun, Liu, et al, Comprehensive understanding to the public health risk of environmental microbes via a microbiome-based index.J. Genet. Genomics, 2022. (通讯)
12. Jing, Zhang, et al., A Scale-Free, Fully Connected Global Transition Network Underlies Known Microbiome Diversity.mSystems, 2021. (通讯)
13. Su*, et al.,Elucidating the Beta-Diversity of the Microbiome: from Global Alignment to Local Alignment.mSystems, 2021.(一作&通讯)
14. Jing, Liu, et al. Microbiome Search Engine 2: a Platform for Taxonomic and Functional Search of Global Microbiomes on the Whole-Microbiome Level.mSystems, 2021. (通讯)
15. Wu, Chen, et al., Towards multi-label classification: Next step of machine learning for microbiome research.Comput. Struct. Biotech. J., 2021. (通讯)
16. Jing, et al. Meta-Apo improves accuracy of 16Samplicon-based prediction of microbiome function.BMC Genomics, 2021. (通讯)
17. Su*, et al., Method development for cross-study microbiome data mining: Challenges and opportunities.Comput. Struct. Biotech. J., 2020. (一作&通讯)
18. Jing, Zhang, et al. Dynamic Meta-Storms enables comprehensive taxonomic and phylogenetic comparison of shotgun metagenomes at the species level.Bioinformatics2020. (通讯)
19. Su*, et al. Multiple disease detection and classification across cohorts via microbiome search.mSystems2020. (一作&通讯)
20. Su*, et al. Reply to Sun et al.,“Identifying Composition Novelty in Microbiome Studies: Improvement of Prediction Accuracy”.mBio2019. (一作&通讯)
知识产权
1.软件著作权：PM-profiler微生物组分析软件，登记号：2024SR0893929
2.软件著作权：Flex Meta-Storms，登记号：2023SR0207831
3.软件著作权：Parallel-Meta Suite，登记号：2022SR0929246
4.软件著作权：微生物组功能分层比对系统，登记号：2021SR0952303
5.软件著作权：微生物组功能校正系统，登记号：2020SR0346691
6.软件著作权：宏基因组动态比对系统，登记号：2020SR0341268
7.软件著作权：微生物组数据库索引与搜索系统2.0,登记号：2018SR279078
8.软件著作权：元基因组数据分析系统，登记号：2016SR053280
9.软件著作权：基因组数据库索引与搜索系统,登记号：2013SR000258
10.软件著作权：并行化高通量测序数据质量控制软件1.0，登记号：2013SR080803
联系方式
Email: suxq-AT-qdu-DOT-edu-DOT-cn
